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中医学诊断疾病包括诊察疾病和辨识证候两方面。故称“善诊者，察色按脉，先别阴阳”。主要表现于分析四诊资料和概括疾病证候的阴阳属性两方面。
望、闻、问、切四诊所收集到的症状和体征医学教|育网搜集整理，常用阴阳来进行分析。如望诊方面，以色泽分阴阳，则鲜明者属阳，晦暗者属阴。切诊方面，以脉象分阴阳，则浮、数、洪、滑等属阳，沉、迟、细、涩等属阴。闻诊方面，以语声分阴阳，则高亢洪亮者属阳，低微无力者属阴。问诊方面，以寒热喜恶分阴阳，则喜寒恶热属阳，喜热恶寒属阴。在症状与体征方面分清了阴阳属性，就为辨证时区别阴阳证候，提供了可靠的依据。
阴阳是“八纲辨证”的总纲。临床辨证中首先分别阴阳证候，有利于认清疾病的本质，并起到执简驭繁的作用。阴阳又可作为虚证以及脏腑辨证之“目”。如对虚证的分类，除气虚、血虚外，还有阴虚、阳虚两类医学教|育网搜集整理；结合脏腑辨证来分析，许多脏腑疾病的证候中，亦有阴虚、阳虚证，如心阴虚、心阳虚、肾阴虚、肾阳虚等等。外科病中的阴证、阳证，亦具有特殊的含义。属于阳证类的疾病，如疖、痈、丹毒、脓肿等，多为急性感染性疾病，表现为红、肿、热、痛等症状；属于阴证类疾病，如结核性感染、肿瘤等，多为慢性疾病，表现为苍白、平塌、不热、不痛或隐痛等症状。