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1、每项商品的项号分两行填报
第一行填报货物在报关单中的商品排列序号。
第二行专用于加工贸易和实行原产地证书联网管理等已备案的货物，
填报该项货物在加工贸易手册中的项号或对应的原产地证书上的商品项号。
例如：一张加工贸易料件进口报关单上某项商品的项号是上“01 ”、下“10”，说明其列此报关单申报商品的第一项，且对应加工贸易手册备案料件第10项
2、特殊情况下填报要求如下：
（1）深加工结转货物，分别按照加工贸易手册中的进口料件项号和出口成品项号填报。
（2）料件结转货物（包括料件、成品和半成品折料）
出口报关单：按照转出加工贸易手册进口料件的项号填报；
进口报关单：按照转入加工贸易手册中进口料件的项号填报。
（3）料件复出货物（包括料件、边角料、来料加工半成品折料），按照加工贸易手册中进口料件的项号填报；料件退换货物（包括料件、不包括半成品），出口报关单按照加工贸易手册中进口料件的项号填报。
（4）成品退运货物，退运进境报关单和复运出境报关单按照加工贸易手册原出口成品的项号填报。
（5）加工贸易料件转内销货物（及按料件补办进口手续的转内销成品、半成品、残次品）应填制进口报关单--填加工贸易手册进口料件的项号；加工贸易边角料、副产品内销--填报加工贸易手册中对应的料件项号。当边角料或副产品对应一个以上料件项号时--填报主要料件项号。
（6）加工贸易成品凭征免税证明转为享受减免税进口货物的，应先办理进口报关手续。
进口报关单--征免税证明中的项号
出口报关单--加工贸易手册原出口成品项号
（7）加工贸易料件、成品放弃--填加工贸易手册中的项号；半成品放弃的应按单耗折回料件，以料件放弃申报--填加工贸易手册中对应的料件项号。
（8）加工贸易副产品退运出口、结转出口或放弃--填加工贸易手册中新增的变更副产品的出口项号。
（9）加工贸易联网企业，需申报报关清单的，应在向海关申报报关单前申报清单。一份报关清单对应一份报关单，报关单商品由报关清单归并而得，加工贸易电子帐册报关单中项号、品名、规格等栏目的填制规范比照加工贸易手册。